全基因组甲基化测序
技术简介
DNA 甲基化是一种非常重要的表观遗传修饰方式,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要的作用。全基因组甲基化测序 (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 是将重亚硫酸氢盐处理方法与高通量测序平台相结合,对有参考基因组物种的DNA 甲基化状态进行全基因组范围内检测,为众多生物学过程、人类健康与疾病的表观遗传机制研究提供强有力的技术手段。
技术路线
送样建议
浓度(Qubit) | 体积 | 总量 | 基因组完整性 |
≥15ng/μL | ≥50 μL | >100 ng | DNA无明显降解,无杂质污染 |
技术参数
全基因组甲基化测序 | 测序策略 | 数据量 | 周期 |
HiSeq2500/4000,PE150 | 30X | 50个工作日起 |
案例分析
单细胞WGBS 揭示细胞分化过程中的表观遗传调控[1]
研究背景
单细胞基因组测序和转录组测序热潮技术加深了我们对细胞异质性研究的认识,然而单细胞表观基因组的研究我们却知之甚少。
研究目的
本研究证实WGBS技术在小细胞群(μWGBS)和单细胞(scWGBS)异质性表观遗传学研究中的应用的可行性,并且提供新的分析思路,为单细胞甲基化研究打下坚实基础。
研究结果
通过对人和小鼠体内单细胞进行WGBS研究,揭示细胞分化的异质性和表观遗传修饰的相关性,并首次绘制人体细胞scWGBS的甲基化谱。
单细胞WGBS技术流程图
参考文献
[1]. Farlik, M. et al. Single-cell DNA methylome Sequencing and bioinformatic inference of epigenomic cell-state dynamics. Cell Rep , 2015, 10:1386-1397,doi:10.1016/j.celrep.2015.02.001 .
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