DIA定量蛋白质组
产品简介
DIA技术主要采用数据非依赖性采集模式(Data-Independent Acquisition,DIA),通过液质联用技术(LC-MS/MS)将整个质谱扫描质量范围分为若干个窗口,依次对每个窗口的所有离子进行碎裂,采集全部子离子信息。
研究方法
DIA流程图
技术优势
全景式扫描,采集所有离子及碎片谱图,数据无遗漏;
鉴定敏感度高,可以鉴定更多低丰度蛋白;
蛋白质覆盖率、定量准确性高;
DIA缺失值更少,结果可重复性高,数据可回溯。
案例解析
家族性帕金森病患者尿蛋白质组分析[1]
研究背景
帕金森病(PD)的患病率正在上升,但是新的治疗策略和治疗方法的发展改变了疾病的进程,这将得益于特异、敏感和无创的生物标志物来早期检测PD。
研究目的
通过尿液蛋白组学进行突变携带者的突变状态和疾病表现进行分类,以及寻找帕金森发生发展生物标志物。
研究结果
基于DIA蛋白组学技术对家族性帕金森病(PD)患者的尿液进行测序分析寻找,揭示了具有LRRK2 G2019S突变的个体中溶酶体失调,结合机器学习,发现尿蛋白组学对于PD患者的生物标志物发现和患者分层具有重要研究价值。
基于质谱的两个独立尿液PD队列的蛋白质组学分析流程
参考文献
[1] Urinary proteome profiling for stratifying patients with familial Parkinson's disease[J]. EMBO Molecular Medicine, 2021.
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