广泛靶向代谢组学
技术简介
广泛靶向代谢组学(Widely targeted metabonomics)是一种整合了非靶向代谢组学“广泛性”和靶向代谢组学“准确性”检测技术优点的新型代谢组检测技术,属于新一代代谢组检测技术。项目实测结果可达一次性定性定量检测800-1200种代谢物质。
技术原理
将目标化合物的质谱参数(RT、Q1、Q3)信息添加进广靶数据库中,构建一个包含数据库中所有化合物信息的质谱方法。基于已构建数据库及检测方法,采用MRM扫描模式采集样本代谢组数据,获得物质的定性及相对定量结果。
服务产品:
技术特点
通量高,数据库大:广靶数据库收录几千种代谢物,含大量次生代谢物
分辨率、灵敏度高:检测下限达pg级,可发现更多低丰度代谢物
定性定量准:AB 6500+三重四极杆定量;自建标品数据库准确定性结果
覆盖广,注释信息全面:覆盖KEGG中90%以上pathway,通路及功能分析准确可靠
技术路线:
送样建议:
(1)样本量要求:
血清/血浆:200 μL/sample
尿液:1mL/sample
动物组织:200mg/sample
粪便/肠道内容:200mg/sample
植物组织:1-2g/sample
(2)生物学重复:
植物:建议8个以上,不低于6个
动物:建议12个以上,不低于8个
临床样品:建议100个以上,不低于30个
案例分析
广泛靶向的代谢组学分析尸体分解对不同类型水体中代谢特征的影响[1]
研究背景
动物尸体在降解过程中会产生许多有毒有害的代谢物,对水安全构成潜在的生态风险,从而威胁人类健康。然而,动物尸体分解产生的代谢物尚不清楚。
研究目的
选择了尸体分解最终阶段(第19天)的样本来研究代谢特征并以鱼类为动物模型,通过广泛靶向的代谢组学,揭示两种水(黄河水和自来水)中水质、微生物和有害代谢物之间的关系。
研究结果
结果显示氨基酸代谢组学、吲哚及其衍生物、吡啶和吡啶衍生物主要发生在尸体组中,表明这些代谢物是尸体分解的标志物。一些有害代谢物(如多胺、胺类、苯和取代衍生物)与尸体分解高度相关,这揭示了如何研究水中有害物质的新见解。这项工作表明,尸体分解通过产生各种有毒代谢物导致水质恶化,从而为暴露于水生环境中的动物尸体时的有毒代谢物提供了新的见解。
图1 广泛靶向代谢组学分析尸体分解产生有毒代谢物整体思路
参考文献
[1] Zhou R, Yu Q, Li T, et al. Carcass decomposition influences the metabolic profiles and enriches noxious metabolites in different water types by widely targeted metabolomics[J]. Chemosphere, 2020, 269:129400.
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