LDR_SNP检测

技术简介

LDR_SNP分型是一种将 PCR 和 LDR（Ligase Detection Reaction，连接酶检测反应）相结合的检测技术。

检测原理

送样建议

注：SNP位点数＞50个，每增加50个位点，体积增加10uL。

技术参数

技术优势

（1）周期短：小试之后，检测周期15个自然日；总检测周期55个自然日。

（2）实验灵活：适合10个以内位点的检测，多重PCR重数可达到10重；

（3）成本低：样本量越大，折合到单个数据点的成本越低。

（4）精准度高：荧光探针标记，传统的3730xl平台；检出率可达95%以上。

案例分析

基于PCR_LDR检测CYP2C19多态性^[1]

研究目的

细胞色素P450 2C19（CYP2C19）基因型与药物代谢差异有关。本研究的目的是基于聚合酶链反应/连接酶检测反应（PCR-LDR）建立CYP2C19基因分型的可靠测定。

 材料方法

设计特异性引物和探针以检测CYP2C19 * 1，* 2，* 3和* 17。制备每个等位基因的对照并用于性能评估，研究采用PCR-LDR和Sanger测序方法对200个临床样品进行检测分析。

研究结果

PCR-LDR检测的检出限为2 ng /μL基因组DNA。血液中常见的干扰物质不会影响检测结果。对于临床样品，PCR-LDR和Sanger测序的结果是相同的。该PCR-LDR检测方法可用于临床环境中CYP2C19基因型的检测。在氯吡格雷和质子泵抑制剂治疗之前，它将是筛查患者CYP2C19功能丧失等位基因的有用工具。

图1 PCR-LDR对CYP2C19基因分型的典型结果

参考文献

Zhang J, Zhang H, Li K, et al. Development of a Polymerase Chain Reaction/Ligase Detection Reaction Assay for Detection of CYP2C19 Polymorphisms[J]. Genet Test Mol Biomarkers. 2018, 22(1):62-73.